Mikėnaitė - lietuviška moteriškos giminės pavardė (mergautinė pavardė).
Šios pavardės kita moteriškosios giminės forma yra: Mikėnienė (ištekėjusi moteris).
Ši pavardė kilusi iš vyriškos giminės pavardės Mikėnas.
Pavardę turi šie garsesni asmenys:
- Akvilė
Mikėnaitė (1912–2001) – Lietuvos muziejininkė, dailėtyrininkė;
- Rima Mikėnaitė (g. 1941) – Lietuvos muzikologė, humanitarinių mokslų daktarė;
