Vaitkūnas - lietuviška vyriškos giminės pavardė.
Šios pavardės moteriškosios giminės formos yra: Vaitkūnienė (ištekėjusi moteris) ir Vaitkūnaitė (mergautinė pavardė).
Pavardę turi šie garsesni asmenys:
- Algirdas Vaitkūnas, Vilkaviškio rajono politikas
- Arūnas Vaitkūnas (1956–2005), tapytojas
- Domas Vaitkūnas (1893–1988) – ūkininkas, kooperatininkas, visuomenės veikėjas, ilgametis Kupiškio valsčiaus viršaitis;
- Gytis Leopoldas Vaitkūnas (g. 1936 m.), menotyrininkas, estetikos istorikas
- Martynas Mažvydas
(Vaitkūnas, 1510–1563) – XVI a. lietuvių rašytojas, pirmosios lietuviškos knygos autorius;
